2002年，北京。以拍DV为业的日本姑娘青山小百合无意间闯入一座四合院，结识了中国青年萧忆。萧忆的爷爷萧汉生由此回忆起60年前，那个对现在年轻人极其陌生的残酷的故事。
1944年的一个狂风暴雨之夜，一艘日本货船底舱挤满了被抓来的国民党战俘、八路军，及一些普通中国百姓。在战俘中有军衔最高的国民党上校团长周尚文和八路军连长萧汉生，还有曾经是特工的夏明远。货船进入日本横滨港，战俘们惊愕地发现已身处日本。
在开往仓津岛的闷罐军车上，战俘和劳工们拥挤在车厢内。虚弱、重伤的劳工和战俘不断地死去，堆积的尸体和活人挤在一起，没有水、没有粮食，离开了祖国的恐惧，笼罩着所有的人。
记忆的证明第2集剧情介绍周尚文和萧汉生等被押到基地，所有的劳工和战俘都被残酷地打上烙印。负责基地建设的是对中国文化极其了解的日本中佐冈田总监。日本学生兵池田和中村在一起诉说对家乡和亲人的思念，他们十分同情劳工们的境遇。
记忆的证明剧照
冈田总监邀请被指定为劳工大队长的周尚文下围棋，在对弈中都对对方有所了解。劳工们出发去工地。
记忆的证明第3集剧情介绍冈田总监与周尚文达成一个协议——周尚文帮助冈田总监尽快完成基地的建设，而冈田总监承诺工程一完工，立刻放全体中国人回家。劳工大队来到秘密工程隧道中，戒备森严的巨大隧道中战俘和劳工艰苦地工作着。
劳工小六子和另一个劳工逃跑被鬼子发现而遭枪杀，尸体吊在悬崖上以示警告。周尚文告诫大家不要逃跑、不要与日本人作对，他相信冈田总监会兑现自己的承诺。周尚文的唯一信念就是把跟自己落难的兄弟们一个不落地带回去。劳工们只好以破坏工程设备来发泄不满。
